Ponpes Huffadh Tasywiqu Al Qur’an berada di Desa Garung Lor RT 06 RW 02, Kecamatan Kaliwungu, Kabupaten Kudus. Ponpes ini didirikan oleh KH. Saifuddin Isma’il pada tahun 2006. Beliau merupakan seorang figur pejuang, kyai muda yang kharismatik, serta tidak kenal putus asa dalam berjuang mensyiarkan islam, mengajarkan ilmu-ilmu agama, dan mendidik masyarakat.
Sejarah berdirinya Ponpes Huffadh Tasywiqu Al Qur’an bermula dari perjuangan KH. Saifuddin yang mengajarkan Al Qur’an dan kitab-kitab salaf di ndalem beliau dan di Musholla Darussalaam (sebelah timur ndalem). Melihat semakin banyaknya masyarakat yang antusias untuk mengaji dan berkhidmat kepada beliau, maka beliau menggagas dan mendirikan Pondok Pesantren Tahfidh, agar masyarakat bisa lebih fokus mendalami Al Qur’an dan berkhidmat kepada beliau. Selain itu juga agar masyarakat senang dengan Al Qur’an kemudian mau menghafalnya. Alhamdulillah asrama untuk mukim santri selesai dibangun pada awal tahun 2008. Dengan adanya asrama tersebut para santri bisa nyaman belajar dan lebih fokus dalam belajar ilmu agama terutama belajar Al Qur’an.
Nama Tasywiqu Al Qur’an dipilih atas hasil istikhoroh beliau, yang mempunyai makna rindu/senang banget dengan Al Qur’an, atau dalam bahasa jawa bermakna beronto maring qur’an. Diharapkan kedepannya para santri mampu mendalami kandungan Al Qur’an dan mengamalkannya. Sesuai dengan sabda Nabi, ”sebaik-baiknya di antara kalian adalah orang yang belajar al qur’an dan mengajarkannya”.
Dalam perkembangannya, alhamdulillah banyak masyarakat yang antusias untuk belajar Al Qur’an dan mendalami ilmu agama di Ponpes Huffadh Tasywiqu Al Qur’an. Tidak hanya dari masyarakat lokal, namun banyak juga yang berasal dari luar daerah, luar provinsi, serta luar Jawa, seperti Kalimantan, Sumatera, dan Sulawesi. Dari masa ke masa sudah ratusan santri bahkan hampir ribuan yang pernah mondok dan mengaji di Pondok Pesantren Huffadh Tasywiqu Al Qur’an. Dan seiring berjalannya waktu Ponpes Huffadh Tasywiqu Al Qur’an mengalamai perkembangan yang sangat pesat. Pada tahun 2013 di pugarlah ndalem lama untuk memperluas asrama santri.
MTs Tahfidh Tasywiqu Al Quran di dirikan pada tanggal 25 Syawwal 1437 H yang bertepatan dengan tanggal 20 Juli 2016. Peletakan batu pertama dilaksanakan oleh pengasuh Pondok Pesantren Tasywiqu Al Quran yaitu KH. Saifuddin Ismail. Adapun lokasinya berada di sebelah barat ndalem Yai / Pondok Pesantren Tasywiqu Al Quran.
Setelah proses pembangunan gedung dan pengurusan izin operasional, akhirnya pada tanggal 17 Romadlon 1438 H / 12 Juni 2017, MTs Tahfidh secara resmi mendapat SK Piagam Pendirian Madrasah dari Kemenag wilayah Jawa Tengah.
Dan pada tanggal 19 Juli 2017 MTs Tahfidh Tasywiqu Al Quran resmi membuka dan menyelenggarakan kegiatan belajar mengajar (KBM) formal. KH Saifuddin turut membuka acara MOPDIK pertama di MTs Tahfidh Tasywiqu Al Quran.
Kemudian pada pertengahan tahun 2018 dibangunlah Masjid dan dua Gedung Madrasah baru (yang saat ini menjadi Gedung MTs dan MA Tahfidh Tasywiqu Al Quran) di sebelah timur pondok lama, ± berjarak 70 meter dari pondok.Setelah selesai pembangunan gedung madrasah akhirnya pada tanggal 14 mei 2020 terbitlah Izin operasional MA Tahfidh Tasywiqu Al qur`an dari kanwil jawa tengah.
dengan demikian Yayasan Tasywiqu Al qur`an mempunyai pendidikan formal jenjang MTs dan MA,yang kurikulumnya mengintegrasikan antara kurikulum pesantren dengan basic tahfidh Al qur`an dan kurikulum nasional.Dengan harapan mampu menghasilkan lulusan yang berkualitas dan bermanfaat.Santri hafidh Al qur`an yang menguasai IPTEK dan berhaluan ahlussunnah wal jama`ah
Demikianlah sekilas Ponpes Huffadh Tasywiqu Al Qur’an dari masa ke masa yang terus mengalami perkembangan.